選擇AAV血清型應根據目標細胞類型和組織來決定。例如，AAV2常用于肝臟、AAV8適用于肌肉、AAV9適用于心臟和中樞神經系統。通過參考文獻或初步實驗，確定最適合的血清型。

AAV滴度可以通過多種方法測定，如實時PCR、酶聯免疫吸附試驗（ELISA）、病毒斑形成單位（PFU）測定等。選擇合適的方法應根據具體實驗需求和實驗室設備條件。

可能原因：

1. 蛋白翻譯后修飾復雜，細胞未能正確處理而導致蛋白被降解

2. 蛋白質含有特殊序列（如高度重復序列），導致蛋白表達低或不正常

3. 表達系統不合適

哺乳動物細胞蛋白表達體系可表達的蛋白大小范圍通常在10 kDa到150 kDa之間。

桿狀病毒-昆蟲細胞表達系統能夠表達具有完整生物學功能的蛋白質，適合容納和表達較大的外源片段，是表達大片段DNA的理想選擇。

雖然桿狀病毒-昆蟲細胞系統不具備哺乳動物細胞的所有翻譯后修飾能力，但它能夠進行一些基本的翻譯后修飾，如糖基化和磷酸化，適合大多數功能研究和生產應用。

酵母表達系統兼具原核和高等真核系統的優點，具有培養條件普通、生長速度快、成本低、可進行蛋白翻譯后加工、易獲得可溶性活性重組蛋白等特點。

巴斯德畢赤酵母因其快速生長、商業化表達載體豐富和高效分泌表達的優點，成為酵母表達重組蛋白的優先選擇。

原核蛋白表達系統（如大腸桿菌）具有快速、高產量、經濟實惠等優勢，適用于大規模蛋白生產。

可以采用密碼子優化、改變表達宿主菌株、調整表達條件（如溫度、培養基組分等）等方法來提高可溶性蛋白的表達水平。

在大腸桿菌表達系統中，部分外源蛋白可能會由于錯誤折疊而形成包涵體，主要原因包括外源蛋白的復雜結構或毒性。

1. 提高蛋白表達量：密碼子優化可以顯著提高外源基因在宿主細胞中的表達量，為后續的分離純化等步驟提供便利。

2. 提高翻譯效率：通過減少稀有密碼子的使用，可以避免翻譯過程中的瓶頸，提高整體的翻譯效率。

3. 改善mRNA穩定性：優化后的mRNA二級結構更加穩定，有利于核糖體的結合和翻譯過程的順利進行。